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马祖琦 尹怀庭 陕西劳动力转移与城镇化发展关系研究 人文地理 CSSCI核心期刊，2001/01
马祖琦 尹怀庭 陕西省粮食单产影响因子分析及粮食灾损评估 经济地理 CSSCI核心期刊，2001/06
刘君德 张俊芳 马祖琦大城市政府职能转变中的区级政区功能定位研究 杭州师范学院学报(社会科学版) 2002/05
刘君德 马祖琦 上海城市精神的立体解读上海城市管理职业技术学院学报 2003/03
马祖琦 刘君德 国外大城市中心城区区级政区职能研究 城市规划 CSSCI核心期刊，2003/03
马祖琦 伦敦中心区“交通拥挤收费政策”——背景、经验与启示国外城市规划 2004/01
马祖琦 海峡两岸大城市市辖区区级行政管理体制比较 经济地理 CSSCI核心期刊，2005/02
马祖琦, 独立, 把握世博会机遇同步推进市民素质建设 , 其他, 世博会与上海市民素质, 2005-06-01
马祖琦, 独立, 上海大都市区级政区虚实转化及其政府职能转变之互动 , 未公开发表部委内参, 国史研究参阅资料（内刊）, 2006-11-01
马祖琦, 独立, 欧洲“健康城市”研究评述 , CSSCI核心期刊, 城市问题, 2007-05-27
马祖琦, 独立, 伦敦中心区“交通拥挤收费”的运作效果、最新进展与相关思考 , 其他, 国际城市规划, 2007-06-01
马祖琦, 独立, 从城市蔓延到理性增长----美国土地利用方式之转变 , CSSCI核心期刊, 城市问题, 2007-10-27
孙晋芳、马祖琦, 其他合作者, 济南和青岛制企业结构效益的比较分析 , 其他, 曲阜师范大学学报, 2008-04-01
马祖琦, 独立, 美国土地利用模式转变的思考与启示 , 其他, 城市经济与土地政策, 2008-01-01
马祖琦、孙晋芳, 第一作者, 美国内城住房问题初探 , 其他, 第13届亚洲房地产学会年会暨国际研讨会, 2008-07-10
马祖琦、沈洪, 第一作者, 美国内城地区零售业态分析及其对我国产业政策和投资决策的启示 , 其他, 理财研究, 2008-08-01
马祖琦、刘君德，浦东新区“功能区域”管理体制与运行机制初探，CSSCI核心期刊，城市问题，2009年第6期， 2009年6月27日； |
